En matière de formation continue, l'IUFM de l'Académie de Lyon développe, pour l'essentiel, son activité en direction des enseignants du primaire et secondaire, commande du Recteur de l'académie de Lyon, dans le cadre du plan académique de formation continue
Plus spécifiquement, dans le cadre de sa politique internationale et de celle de l'Université Claude Bernard Lyon1, dont il est l'une des composantes, l''IUFM est susceptible d'organiser en France ou à l'étranger, des stages de perfectionnement professionnel à durée variable pour des enseignants, des enseignants-chercheurs ou des personnels d'encadrement ou d'inspection. A la demande du ministère des affaires étrangères ou du secrétariat d'état à la coopération, l'IUFM a pu mettre en place des stages plus particulièrement destinés aux pays d'Afrique francophone et du Maghreb. En relation avec le Délégué Académique à la Formation des Personnels du rectorat de Lyon (DAFOP), les formateurs de l'IUFM sont sollicités pour intervenir dans les établissements français de l'Asie du Sud Est.